Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTTNBP2Q8WZ74 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms