Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAAF4Q8WXU2 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms