Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAAF3Q8N9W5 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAAF3Q8N9W5 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAAF3Q8N9W5 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAAF3Q8N9W5 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAAF3Q8N9W5 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAAF3Q8N9W5 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAAF3Q8N9W5 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAAF3Q8N9W5 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DNAAF3Q8N9W5 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAAF3Q8N9W5 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAAF3Q8N9W5 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAAF3Q8N9W5 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAAF3Q8N9W5 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAAF3Q8N9W5 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAAF3Q8N9W5 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAAF3Q8N9W5 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAAF3Q8N9W5 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAAF3Q8N9W5 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAAF3Q8N9W5 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAAF3Q8N9W5 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAAF3Q8N9W5 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAAF3Q8N9W5 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAAF3Q8N9W5 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAAF3Q8N9W5 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAAF3Q8N9W5 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAAF3Q8N9W5 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAAF3Q8N9W5 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAAF3Q8N9W5 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAAF3Q8N9W5 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAAF3Q8N9W5 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAAF3Q8N9W5 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAAF3Q8N9W5 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAAF3Q8N9W5 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAAF3Q8N9W5 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAAF3Q8N9W5 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAAF3Q8N9W5 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAAF3Q8N9W5 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAAF3Q8N9W5 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAAF3Q8N9W5 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DNAAF3Q8N9W5 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DNAAF3Q8N9W5 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms