Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVOPQ8N4V2 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVOPQ8N4V2 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms