Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC103Q8IW40 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms