Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
P3H3Q8IVL6 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms