Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KCNMB4Q86W47 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms