Protein–RNA interactions for Protein: Q86UR5

RIMS1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS1Q86UR5 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIMS1Q86UR5 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIMS1Q86UR5 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIMS1Q86UR5 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIMS1Q86UR5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIMS1Q86UR5 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RIMS1Q86UR5 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIMS1Q86UR5 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIMS1Q86UR5 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIMS1Q86UR5 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RIMS1Q86UR5 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RIMS1Q86UR5 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIMS1Q86UR5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIMS1Q86UR5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIMS1Q86UR5 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIMS1Q86UR5 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIMS1Q86UR5 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIMS1Q86UR5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIMS1Q86UR5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIMS1Q86UR5 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIMS1Q86UR5 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIMS1Q86UR5 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIMS1Q86UR5 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIMS1Q86UR5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIMS1Q86UR5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIMS1Q86UR5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIMS1Q86UR5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms