Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT28Q7Z3Y7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT28Q7Z3Y7 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms