Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHA9Q7RTU4 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms