Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR52

ZNF493, Zinc finger protein 493, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF493Q6ZR52 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ZNF493Q6ZR52 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms