Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC141Q6ZP82 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC141Q6ZP82 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms