Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRIG3Q6UXM1 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRIG3Q6UXM1 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms