Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms