Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL35Q6PF15 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms