Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PPP4R4Q6NUP7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms