Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMBOX1Q6NT76 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HMBOX1Q6NT76 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms