Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GARNL3Q5VVW2 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GARNL3Q5VVW2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms