Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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C10orf55Q5SWW7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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