Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SAPCD1Q5SSQ6 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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