Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTXN3Q4LDR2 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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