Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL38Q2WGJ6 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL38Q2WGJ6 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms