Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTC1Q2NKJ3 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms