Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MSMPQ1L6U9 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms