Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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