Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM187BQ17R55 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
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FAM187BQ17R55 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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FAM187BQ17R55 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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