Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMA3Q16787 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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