Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NTRK2Q16620 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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