Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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