Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYPL1Q16563 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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