Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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ZFHX3Q15911 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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ZFHX3Q15911 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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ZFHX3Q15911 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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ZFHX3Q15911 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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ZFHX3Q15911 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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