Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ITSN1Q15811 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms