Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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ALX1Q15699 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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ALX1Q15699 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ALX1Q15699 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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