Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP10Q15642 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms