Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CDSNQ15517 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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CDSNQ15517 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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CDSNQ15517 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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CDSNQ15517 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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CDSNQ15517 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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CDSNQ15517 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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CDSNQ15517 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CDSNQ15517 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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