Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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SYCP1Q15431 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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SYCP1Q15431 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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SYCP1Q15431 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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SYCP1Q15431 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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SYCP1Q15431 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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SYCP1Q15431 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
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