Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSME4Q14997 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms