Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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