Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
EXOSC2Q13868 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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