Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOFQ13790 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOFQ13790 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOFQ13790 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOFQ13790 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APOFQ13790 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOFQ13790 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOFQ13790 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOFQ13790 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOFQ13790 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOFQ13790 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOFQ13790 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOFQ13790 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APOFQ13790 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOFQ13790 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOFQ13790 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOFQ13790 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOFQ13790 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOFQ13790 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOFQ13790 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOFQ13790 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOFQ13790 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOFQ13790 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOFQ13790 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOFQ13790 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOFQ13790 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOFQ13790 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOFQ13790 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOFQ13790 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOFQ13790 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOFQ13790 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOFQ13790 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOFQ13790 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOFQ13790 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOFQ13790 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOFQ13790 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOFQ13790 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOFQ13790 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOFQ13790 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOFQ13790 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOFQ13790 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOFQ13790 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOFQ13790 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOFQ13790 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOFQ13790 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOFQ13790 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOFQ13790 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOFQ13790 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOFQ13790 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOFQ13790 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOFQ13790 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOFQ13790 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOFQ13790 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOFQ13790 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOFQ13790 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOFQ13790 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOFQ13790 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOFQ13790 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOFQ13790 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOFQ13790 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOFQ13790 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOFQ13790 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOFQ13790 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOFQ13790 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOFQ13790 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOFQ13790 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOFQ13790 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOFQ13790 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOFQ13790 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOFQ13790 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOFQ13790 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOFQ13790 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
APOFQ13790 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOFQ13790 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
APOFQ13790 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOFQ13790 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOFQ13790 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
APOFQ13790 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOFQ13790 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOFQ13790 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOFQ13790 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOFQ13790 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOFQ13790 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOFQ13790 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOFQ13790 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOFQ13790 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOFQ13790 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOFQ13790 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOFQ13790 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOFQ13790 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOFQ13790 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOFQ13790 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOFQ13790 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOFQ13790 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOFQ13790 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOFQ13790 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
APOFQ13790 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOFQ13790 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOFQ13790 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
APOFQ13790 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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