Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CUL1Q13616 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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