Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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PEX6Q13608 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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PEX6Q13608 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX6Q13608 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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