Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PKD2Q13563 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKD2Q13563 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms