Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LSAMPQ13449 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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