Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
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MKRN4PQ13434 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
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MKRN4PQ13434 AC007991.4-201ENST00000522970 605 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
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MKRN4PQ13434 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
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MKRN4PQ13434 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MKRN4PQ13434 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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MKRN4PQ13434 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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MKRN4PQ13434 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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MKRN4PQ13434 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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MKRN4PQ13434 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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MKRN4PQ13434 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
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MKRN4PQ13434 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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