Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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