Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
STRN3Q13033 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
STRN3Q13033 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms