Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FOXD4Q12950 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXD4Q12950 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
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