Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXC1Q12948 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXC1Q12948 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms