Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPRJQ12913 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
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PTPRJQ12913 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
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PTPRJQ12913 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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